История развития здравоохранения на ст. Барабинск связана со строительством Сибирской железнодорожной магистрали.

Первое упоминание о медучреждении на ст. Каинск, Каинского уезда, Томской губернии относится к 1893 - 1895гг. здесь работали один врач и два фельдшера. По состоянию на август 1906 год отмечено, что на Сибирской железной дороге существовало 26 Врачебных участков, кроме того, функционировали 29 Врачебных пунктов, в том числе на ст. Каинск.

С 1917 года ст. Каинск переименована в ст. Барабинск с населением 5 630 человек, а по второй всероссийской переписи в 1920 году 8 296 человек. Медицинское обслуживание населения обеспечивал приемный покой, который находился вблизи вокзала «Приемный покой – одноэтажное деревянное здание. Состоял из 8 комнат, в нем располагалась аптека, 4 комнаты приема амбулаторных больных, кабинет зав. приемным покоем, перевязочная для приема хирургических и гинекологических больных, она же – родовая для тяжелых родов и комната дежурного персонала».

К 1940 году больница имела 170 коек: из них терапевтических – 45, хирургических с гинекологическими – 45, родильных – 25, детских – 15, туберкулезных – 25, ночной туберкулезный санаторий на 15 коек; специализированную взрослую поликлинику с приемом детей после 3-х лет жизни; три здравпункта (депо паровозного, вагонного участка, совхоза №4); три фельдшерско-акушерских пункта и три родильных дома на ст. Убинское, Кожурла, Пенек. Оказывали стационарно-поликлиническую помощь 14 врачей.

На основании распоряжения ВСС от 08.07.43г. № 59 идет разделение имущества и штатов поликлиники и больницы до 09.03.1948 года.

В 1953г. был открыт поликлинический корпус, где разместилась лаборатория, хирургический и дерматовенерологические кабинеты, позже туберкулезный кабинет.

В 1954 году детское отделение расширяется до 45 коек и переводится на ул. Советская № 131, а терапевтическое отделение с инфекционными койками переводится в двухэтажное кирпичное здание на ул. Песчаной (сейчас здание ШЧ-5), открыт рентген-кабинет.

В 1957 году после реконструкции «дома отдыха локомотивных бригад» открывается хирургическое отделение на 60 коек, включая оказание помощи женщинам с гинекологическими заболеваниями.

В эти годы улучшается неотложная стационарная помощь: круглосуточные дежурства хирургов, операционного блока.

Улучшились условия работы поликлинической службы: лаборатории, физиокабинета, рентгенкабинета и инфекционного (переведены в бывшее здание хирургического отделения), женская консультация переехала на ул. Ленина № 110 (126) в восточное крыло.

В январе 1962 года 12 Врачебный участок получил статус отделенческой больницы ЗСЖД.

Штат отделенческой больницы на 1965г. – 431,5 ставок врачебных – 61,5; физических лиц – 33; коечный фонд 270; 2 амбулатории (на ст. Каргат и ст. Пенек), 10 фельдшерских пунктов.

19 ноября 1968 года открыт медпункт на вокзале, который именовался «скорой помощью». В 1968 году началось строительство взрослой поликлиники на 500 посещений в смену.

В 1972 году сдана типовая поликлиника, 3-х этажное здание с административным корпусом, лабораторией, женской консультацией, пунктом переливания крови, рентген - зубопротезными кабинетами. Улучшились условия всех служб поликлиники.

В больнице было развернуто социалистическое соревнование за звание «Ударник коммунистического труда», «Отделение коммунистического труда».

В 1970 году больница завоевала первое место среди ЛПУ дороги и переходящее Красное Знамя.

Больница стала базой подготовки интернов, средних мед. работников и студентов вузов и мед. училищ. Шла активная учеба врачей, мед. сестер на местных базах дороги и центральных институтов. В коллектив больницы влились молодые кадры: хирурги, терапевты, педиатры и другие узкие специалисты.

В феврале 1980 года началось строительство больничного комплекса.

В марте 1984 года сдано в эксплуатацию детское отделение на 45 коек (боксированное с приемным покоем) – двухэтажное кирпичное здание, 1 очередь больничного комплекса, которое работало до 30 декабря 2001 года, с 2002г. детское отделение закрыто, а стационарная педиатрическая помощь передана в ЦРБ.

21 июля 2003 года в это здание после евроремонта и реконструкции перешла взрослая поликлиника на 340 посещений в смену.

В 1986 году принял в эксплуатацию пятиэтажный больничный комплекс (терапевтическое отделение с неврологическими койками на 80 коек, хирургическое отделение на 60 коек, акушерско-гинекологическое отделение на 55 коек, операционный блок, операционный блок родильного отделения, параклинические службы: лаборатория, физио-, рентген отделения, эндоскопический кабинет, автоклавная, патологоанатомический корпус, прачечная, пищеблок, административно-хозяйственные помещения, приемный покой для терапевтических, хирургических и гинекологических больных и другие вспомогательные службы.

В 1986 году после реконструкции административного корпуса во взрослой поликлинике открыт стационарный флюорографический кабинет, улучшились условия ЭКГ- кабинета и работников регистратуры.

В 1987г. – открыто туберкулезное отделение на 60 коек для обслуживания всего населения города и района (бывшее хирургическое отделение) на ул. Вокзальной. С января 2002 года передано в городской отдел з/о.

К 1990 году коечный фонд больницы составил 300 коек, детская поликлиника на 250 посещений в смену, взрослая поликлиника – 500 посещений, 9 фельдшерских пунктов, 5 здравпунктов (локомотивное депо, вагонное депо, ПЧ-8, НГЧ-3, подс.хоз Ульяновский).

После 1990 года началась реорганизация здравоохранения.

В 1998 закрыли родильное отделение, сократили койки в детском и терапевтических отделениях. Открыли неврологическое отделение на 30 коек, ОРИТ на три койки, коечный фонд в гинекологическом отделении увеличился до 40. Больница стала располагать 280 койками.

С января 2002 года детство и туберкулезное отделение переданы горздравотделу. В больнице осталось 120 коек, в каждом отделении по 30 коек (хирургия, терапия, неврология, гинекология).

С января 2002 году открыт дневной стационар на 30 коек в две смены.

С 01 марта 2005 года ГУЗ «Узловая больница на ст. Барабинск» ФГУП ЗСЖД МПС России» переименована в НУЗ «Узловая больница на ст. Барабинск ОАО «РЖД».

С 1 июля 2013 года приказом министерства здравоохранения Новосибирской области №1462 от 14.05.2013 года экстренная помощь передана в ГБУЗ НСО «Барабинская центральная районная больница».

С 12 января 2014 года стационар круглосуточного пребывания работает на 30 коек.

С 1 мая 2014 года дневной стационар при поликлинике работает на 10 коек в две смены.

В 2016 году больнице исполнился юбилей - 120 лет.